Родился в с. Гавриловском ныне Суздальского района Владимирской области в семье крестьянина. В Красной армии в 1925–1936, 1939–1940 гг. и с 1941 г. В 1927 г. окончил пограничную школу в Минске. С 1928 г. в течение четырех лет был командиром первой чукотской погранзаставы. Член Анадырского райревкома в 1930–1931 гг., решал вопросы управления и социально-экономического развития огромной территории, оберегая интересы коренного населения от посягательства американских торговцев. Участник советско-финляндской войны 1939–1940 гг., участник Великой Отечественной войны с 1941 г. 20–30 сентября 1943 г. батальон 207-го гвардейского полка под командованием старшего лейтенанта Ишутина успешно форсировал Днепр, затем Припять юго-западнее г. Чернобыль (Украина), отличился в бою за расширение плацдарма, отразив несколько вражеских контратак. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 16 октября 1943 г. за форсирование реки Днепр гвардии старшему лейтенанту Ишутину Н. Ф. присвоенное звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 1816). С 1945 г. Ишутин – в запасе в звании капитана. Жил и работал в пос. Ратомка Минского района Минской области (Белоруссия). Награжден орденами Ленина, Отечественной войны I степени, Красной Звезды, медалями. Одной из застав Чукотского автономного округа присвоено имя Николая Ишутина.